MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017798	CTT	2	6	527	532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858794
2	NC_017798	AGT	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858794
3	NC_017798	TTA	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858794
4	NC_017798	TAA	2	6	595	600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858794
5	NC_017798	CTT	2	6	678	683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858794
6	NC_017798	ATC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858794
7	NC_017798	GTTTT	2	10	726	735	0 %	80 %	20 %	0 %	386858794
8	NC_017798	ATC	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858794
9	NC_017798	TGC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858794
10	NC_017798	T	7	7	927	933	0 %	100 %	0 %	0 %	386858794
11	NC_017798	TCT	2	6	1020	1025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858794
12	NC_017798	CCTT	2	8	1062	1069	0 %	50 %	0 %	50 %	386858794
13	NC_017798	TCCT	2	8	1084	1091	0 %	50 %	0 %	50 %	386858794
14	NC_017798	TCC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858794
15	NC_017798	ATA	2	6	1118	1123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858794
16	NC_017798	ATTT	2	8	1464	1471	25 %	75 %	0 %	0 %	386858795
17	NC_017798	AAC	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858795
18	NC_017798	GACT	2	8	1497	1504	25 %	25 %	25 %	25 %	386858795
19	NC_017798	TC	3	6	1551	1556	0 %	50 %	0 %	50 %	386858795
20	NC_017798	ATT	2	6	1590	1595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858795
21	NC_017798	AGC	3	9	1664	1672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858795
22	NC_017798	ACC	2	6	1682	1687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858795
23	NC_017798	GCT	3	9	1713	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858795
24	NC_017798	TAG	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858795
25	NC_017798	AGC	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858795
26	NC_017798	GCT	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858795
27	NC_017798	GCT	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858795
28	NC_017798	CTG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858795
29	NC_017798	GCA	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858795
30	NC_017798	GCA	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858795
31	NC_017798	AGT	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858795
32	NC_017798	GCA	2	6	1962	1967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858795
33	NC_017798	TAC	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858795
34	NC_017798	CCA	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858795
35	NC_017798	TAA	2	6	2026	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858795
36	NC_017798	AAT	2	6	2048	2053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858795
37	NC_017798	AGC	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858795
38	NC_017798	GTA	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858795
39	NC_017798	CAT	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858795
40	NC_017798	TAAT	2	8	2146	2153	50 %	50 %	0 %	0 %	386858795
41	NC_017798	CAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858795
42	NC_017798	CTA	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858796
43	NC_017798	CTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
44	NC_017798	TCT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
45	NC_017798	TCT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
46	NC_017798	AAC	2	6	3051	3056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858796
47	NC_017798	CTG	2	6	3064	3069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
48	NC_017798	TTA	2	6	3102	3107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858796
49	NC_017798	TCC	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858796
50	NC_017798	CTG	2	6	3208	3213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
51	NC_017798	TCC	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858796
52	NC_017798	GCT	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
53	NC_017798	TCT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
54	NC_017798	TCTCC	2	10	3313	3322	0 %	40 %	0 %	60 %	386858796
55	NC_017798	TGC	2	6	3344	3349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
56	NC_017798	CTG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
57	NC_017798	GCA	2	6	3372	3377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858796
58	NC_017798	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	386858796
59	NC_017798	CTT	2	6	3457	3462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
60	NC_017798	CTTT	2	8	3514	3521	0 %	75 %	0 %	25 %	386858796
61	NC_017798	TGC	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
62	NC_017798	TTG	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858796
63	NC_017798	CTT	2	6	3682	3687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
64	NC_017798	CTG	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858796
65	NC_017798	TCT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
66	NC_017798	CTT	2	6	3867	3872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
67	NC_017798	TCC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858796
68	NC_017798	CTC	3	9	3916	3924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858796
69	NC_017798	CAT	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858796
70	NC_017798	TTC	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858796
71	NC_017798	CT	3	6	3997	4002	0 %	50 %	0 %	50 %	386858797
72	NC_017798	TC	3	6	4006	4011	0 %	50 %	0 %	50 %	386858797
73	NC_017798	CT	3	6	4015	4020	0 %	50 %	0 %	50 %	386858797
74	NC_017798	CT	3	6	4025	4030	0 %	50 %	0 %	50 %	386858797
75	NC_017798	CTT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858798
76	NC_017798	TCT	2	6	4360	4365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858798
77	NC_017798	TAA	2	6	4374	4379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858798
78	NC_017798	CACT	2	8	4391	4398	25 %	25 %	0 %	50 %	386858798
79	NC_017798	CTG	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858798
80	NC_017798	T	6	6	4415	4420	0 %	100 %	0 %	0 %	386858798
81	NC_017798	TAT	2	6	4433	4438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858798
82	NC_017798	CCT	2	6	4483	4488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858798
83	NC_017798	GCT	2	6	4507	4512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858798
84	NC_017798	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858798
85	NC_017798	TGC	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858798
86	NC_017798	TCT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858798
87	NC_017798	TGA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858798
88	NC_017798	TGC	3	9	4662	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858798
89	NC_017798	CTG	2	6	4682	4687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858798
90	NC_017798	AGT	2	6	4695	4700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858798
91	NC_017798	CTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858798
92	NC_017798	TAT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858798
93	NC_017798	CTTT	2	8	4832	4839	0 %	75 %	0 %	25 %	386858798
94	NC_017798	TTG	2	6	4877	4882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858798
95	NC_017798	ACCT	2	8	4887	4894	25 %	25 %	0 %	50 %	386858798
96	NC_017798	ATC	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858798
97	NC_017798	T	6	6	4987	4992	0 %	100 %	0 %	0 %	386858798
98	NC_017798	CTTG	2	8	5025	5032	0 %	50 %	25 %	25 %	386858798
99	NC_017798	TTA	2	6	5119	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858798
100	NC_017798	CT	3	6	5176	5181	0 %	50 %	0 %	50 %	386858798
101	NC_017798	CTC	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858798
102	NC_017798	CAT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858798
103	NC_017798	CTC	3	9	5228	5236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858798
104	NC_017798	CAT	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858798
105	NC_017798	CAC	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858798
106	NC_017798	CAT	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858798
107	NC_017798	TAC	2	6	5310	5315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858798
108	NC_017798	CTT	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858798
109	NC_017798	TTCT	3	12	5329	5340	0 %	75 %	0 %	25 %	386858798
110	NC_017798	TCA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858798
111	NC_017798	TCT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858799
112	NC_017798	CTG	2	6	5998	6003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858799
113	NC_017798	CTG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858799
114	NC_017798	CCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858799
115	NC_017798	CACT	2	8	6097	6104	25 %	25 %	0 %	50 %	386858799
116	NC_017798	CTC	3	9	6148	6156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858799
117	NC_017798	TTG	2	6	6175	6180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858799
118	NC_017798	TCT	2	6	6252	6257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858799
119	NC_017798	TGA	2	6	6266	6271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858799
120	NC_017798	TGC	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858799
121	NC_017798	TCC	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858799
122	NC_017798	CTG	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858799
123	NC_017798	T	6	6	6342	6347	0 %	100 %	0 %	0 %	386858799
124	NC_017798	GCC	2	6	6356	6361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858799
125	NC_017798	CTC	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858799
126	NC_017798	ATT	2	6	6435	6440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858799
127	NC_017798	TTA	2	6	6522	6527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858799
128	NC_017798	TGT	2	6	6569	6574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858799
129	NC_017798	CTT	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858799
130	NC_017798	ATT	2	6	7440	7445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858800
131	NC_017798	CTATC	2	10	7467	7476	20 %	40 %	0 %	40 %	386858800
132	NC_017798	TAT	2	6	7546	7551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858800
133	NC_017798	TGC	3	9	7582	7590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858800
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.